長(zhǎng)垣縣境內(nèi)有浮丘店仰韶文化遺址，大崗、宜丘、蘇墳等 龍山文化遺址，可以證明六千年前就有人類(lèi)在此勞動(dòng)生息。長(zhǎng)垣，西周時(shí)屬衛(wèi)國(guó)。春秋時(shí)期，衛(wèi)國(guó)于長(zhǎng)垣之地同時(shí)置蒲邑（今長(zhǎng)垣縣城）、匡邑。匡城遺址在今長(zhǎng)垣縣城西南10公里的張寨鄉(xiāng)孔莊村一帶，舊名為匡主。著名的匡人圍孔，就發(fā)生在此地。

戰(zhàn)國(guó)時(shí)期，衛(wèi)之匡邑、蒲邑，被魏國(guó)兼并，在今縣城東北5公里的陳墻村一帶，置首垣邑。此地在當(dāng)時(shí)有一道長(zhǎng)墻，或曰防垣。此防垣或用于防水，或用于防兵，此時(shí)已有“長(zhǎng)垣”之名。根據(jù)楊寬所著的《戰(zhàn)國(guó)史》載：“魏在沿黃河地區(qū)還有圓錢(qián)（無(wú)郭）流通，鑄造的城市主要有共、垣、長(zhǎng)垣（今河南省長(zhǎng)垣縣東北）等城。長(zhǎng)垣所鑄有‘長(zhǎng)垣一釿’、‘長(zhǎng)瞏一釿’。當(dāng)時(shí)鑄錢(qián)多用于地名，可見(jiàn)當(dāng)時(shí)的防垣很長(zhǎng)，故稱(chēng)長(zhǎng)垣，而首垣則為防垣之首，長(zhǎng)垣名由此而來(lái)，清代以前陳墻村還稱(chēng)為墻里村，至今還有以墻命名的村莊。圍魏救趙就發(fā)生于此，史稱(chēng)桂陵之戰(zhàn)。

隋初仍名長(zhǎng)垣縣。開(kāi)皇十六年（公元596年）移縣治于婦姑城（今城南司坡一帶），因該城西南有古匡城，故改為匡城縣；同年又于韋城（在今滑縣東南妹村）置長(zhǎng)垣縣。大業(yè)元年（公元605年）廢匡城縣并入長(zhǎng)垣，皆屬東郡。唐朝武德元年（公元618年），仍分匡城、長(zhǎng)垣兩縣，皆屬河南道滑州。貞觀八年（公元634年）廢長(zhǎng)垣縣又并入匡城縣。五代時(shí)，后梁改匡城為長(zhǎng)垣，屬東都開(kāi)封府；后唐改為匡城縣，屬汴州；后晉匡城仍屬之；后漢、后州不變，以至于宋。宋建隆元年（公元960年），為避太祖“匡”字諱，改匡城為鶴丘縣。大中詳符二年（1009）年復(fù)改為長(zhǎng)垣縣。自隋至金初歷時(shí)608年，縣治皆在今司坡一帶。金明昌五年（1194年），黃河改道，自陽(yáng)武東流，為避水患，于泰和四年（1204年）遷縣治于苗寨鄉(xiāng)柳冢一帶。

元初，曾改縣為保保州，不久仍改為長(zhǎng)垣縣。金、元兩代計(jì)165年，縣治均在柳冢一帶。

明屬大名府開(kāi)城。洪武二年因黃河水患，遷縣治蒲城鎮(zhèn)，即今縣治所在地。

清屬直隸省大名府。民國(guó)18年改隸屬河北省，長(zhǎng)垣屬之。

抗日戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期，國(guó)民黨、日偽、抗日民主政府并存。1941年，中共領(lǐng)導(dǎo)的冀、魯、豫行署第四專(zhuān)署決定將長(zhǎng)垣縣河?xùn)|部分北部劃歸東垣縣抗日民主政府管轄；1943年，又決定將長(zhǎng)垣西北部劃歸衛(wèi)南縣抗日民主政府管轄。同時(shí)，劃長(zhǎng)（垣）、滑、濮（陽(yáng)）、東（明）四縣邊區(qū)成立濱河縣抗日民主政府，1945年撤銷(xiāo)，歸長(zhǎng)垣縣人民政府，縣政府在佘家、丁欒一帶辦公。1947年解放長(zhǎng)垣城。1947年春，縣人民政府進(jìn)駐縣城。1949年長(zhǎng)垣縣屬新建的平原省濮陽(yáng)專(zhuān)區(qū)；1952年12月平原省撤銷(xiāo)，并入河南省，長(zhǎng)垣屬河南省濮陽(yáng)專(zhuān)區(qū)；1954年濮陽(yáng)專(zhuān)區(qū)撤銷(xiāo)，改屬新鄉(xiāng)專(zhuān)區(qū)；1955年2月，劃歸安陽(yáng)專(zhuān)區(qū)；1958年4月，安陽(yáng)專(zhuān)區(qū)撤銷(xiāo)，長(zhǎng)垣又屬新鄉(xiāng)專(zhuān)區(qū)；1961年12月，安陽(yáng)專(zhuān)區(qū)恢復(fù)，長(zhǎng)垣又復(fù)歸安陽(yáng)；1983年，安陽(yáng)專(zhuān)區(qū)撤銷(xiāo)，長(zhǎng)垣屬新設(shè)的濮陽(yáng)市。1986年3月劃歸新鄉(xiāng)市。2011年6月1日起，河南省正式開(kāi)展省直管縣行政體制改革試點(diǎn)工作,長(zhǎng)垣為河南省十個(gè)省直管縣試點(diǎn)縣之一，成為省政府直管縣。

改革開(kāi)放后，長(zhǎng)垣人自力更生，努力奮斗，緊跟國(guó)家政策變化與時(shí)代要求，在摸索與先進(jìn)中獲得了加大的經(jīng)濟(jì)進(jìn)步，并形成特殊的“長(zhǎng)垣模式”。但縣域內(nèi)，城鄉(xiāng)貧富差距巨大，有待改善！