在放開外貿(mào)經(jīng)營權的同時，馬其頓也放開了大部分商品的經(jīng)營權。目前馬97％的商品可以自由進出口，主要通過價值規(guī)律和市場機制加以調(diào)節(jié)。

　　馬其頓對個別需要保護國內(nèi)產(chǎn)業(yè)的和敏感的商品實行配額和限量進出口管理。在進口方面，受配額管理的商品占2％，包括馬本國生產(chǎn)的部分產(chǎn)品和全部農(nóng)產(chǎn)品；在出口方面，主要為防止自然資源的過量出口而采取配額管理。另外，根據(jù)馬其頓與歐盟簽署的經(jīng)貿(mào)協(xié)定，馬向歐盟出口紡織品、農(nóng)產(chǎn)品和食品受被動配額限制。

　　馬其頓政府每年10月31日頒布下一年的配額量、配額貿(mào)易的地區(qū)定向和發(fā)放配額的進度。配額分配采取招標形式，同時留出10％的配額量用于機動（如未曾預料的新的生產(chǎn)進口需要、在馬舉辦博覽會進口需要等），配額有效期為一年。對馬外交部批準的易貨貿(mào)易項目，涉及到受配額管理的進出口商品可事先得到安排。

　　馬其頓對有關國家安危的戰(zhàn)略物資和重要物資實行許可證管理，主要為軍火、稀有貴重金屬、麻醉品、有毒物質、屬于危險品的廢料、文物等。

　　另外，對有動植物檢疫、衛(wèi)生檢查或品質檢驗的商品，需獲得馬外交部頒發(fā)的許可證后方可進口。